期刊论文在知网查重的原理主要是通过文本比对技术，检测论文中的文字是否与知网数据库中的内容相似度过高。知网查重系统会将上传的论文与其数据库中的期刊、学位论文等进行比对，通过比对结果来判断论文的原创性。这一过程主要依靠计算机算法，对文本进行分析和匹配，最终生成查重报告。同时，知网查重还会检测论文中的图片、表格等内容，确保整篇论文的原创性。

期刊论文在知网查重的方法包括直接检测和间接检测两种。直接检测是指将待查重论文与知网数据库中的文献进行比对，直接给出查重结果。间接检测则是通过计算机算法对论文进行分析，检测其中的相似度和重复率，最终生成查重报告。在查重过程中，还会考虑引用文献和参考资料的情况，以避免误判。综合利用这两种方法，可以有效保障期刊论文的学术诚信和质量。